中國國家基因庫正式對外運營 系世界最大的基因庫
國家基因庫。
歷時5年的建設,9月22日,中國首個國家基因庫宣布正式對外運營。
這是繼美國、日本和歐盟之后,全球第四個建成的國家級基因庫,也是目前為止世界最大的基因庫。
國家基因庫將以生物資源為依托,形成資源到科研到產(chǎn)業(yè)的全貫穿、全覆蓋模式,應用方向包括人類健康、新型農(nóng)業(yè)、物種多樣性及生態(tài)環(huán)境保護等。未來,國家基因庫還將依照相關規(guī)則開放樣本、數(shù)據(jù)資源,成為一個公共服務平臺,在基因測序和基因育種等方面發(fā)揮重要作用。
位于觀音山腳下的國家基因庫。
國家基因庫是目前全球最大的基因庫
國家基因庫位于深圳市大鵬新區(qū)觀音山腳下,占地面積超過5萬平方米,建筑總面積11.6萬平方米。其中,一期面積為4.75萬平方米。2011年,該基因庫由國家發(fā)展改革委、財政部、工業(yè)和信息化部、國家衛(wèi)生和計劃生育委員會聯(lián)合批復,并由華大基因最終負責承建運營。
深圳國家基因庫主任、華大農(nóng)業(yè)集團董事長兼總裁梅永紅曾對媒體表示,國家基因庫選址深圳主要考慮三個因素:一是方便利用臨近的LNG(液化天然氣)碼頭氣化過程中產(chǎn)生的大量冷能,用于冷卻樣品,節(jié)能環(huán)保;二是國家基因庫的主體建筑是倚山體的自然坡度建設的,每一層都相當于是第一層,都有山體結構的支撐,穩(wěn)固性好,可擺放大型設備;三是深圳正在全力推進“東進戰(zhàn)略”,將在深圳東部的大鵬半島規(guī)劃建設國際生物谷,并將其打造成為國際領先的生物科技創(chuàng)新中心,國家基因庫是大鵬新區(qū)的重要產(chǎn)業(yè)基礎設施,有助于生物產(chǎn)業(yè)提升創(chuàng)新能力。
官網(wǎng)資料顯示,深圳國家基因庫初步建成“三庫兩平臺”的結構業(yè)務和功能,“三庫”由生物資源樣本庫、生物信息數(shù)據(jù)庫和生物活體庫組成,“兩平臺”為數(shù)字化平臺、合成與編輯平臺。國家基因庫搭建起基因資源挖掘的基礎性支撐及公共服務平臺,以具備對海量生物資源的存、讀、懂、寫、用能力為基礎,構建起檢測、管理、認證、基礎應用體系,促進基因組學在精準健康、精準農(nóng)業(yè)、海洋開發(fā)、微生物應用等方面的前沿探索與產(chǎn)業(yè)轉化,催生新技術、新產(chǎn)品和新模式。
深圳國家基因庫是繼NCBI(美國國立生物技術信息中心)、EMBL-EBI(歐洲生物信息研究所)、DDBJ(日本DNA數(shù)據(jù)庫)全球三大國家級基因庫后的第四個國家級基因庫,但它與另外三個數(shù)據(jù)庫有著自己獨特的地方。國家基因庫執(zhí)行主任、華大基因研究院院長徐訊在接受央視新聞采訪時稱,與其他三大國家數(shù)據(jù)庫以保存數(shù)據(jù)為主要功能不同的是,深圳國家數(shù)據(jù)庫不僅有數(shù)字化平臺積累別人產(chǎn)生的數(shù)據(jù),還可以保存樣品等,是一個綜合的數(shù)據(jù)庫。深圳國家數(shù)據(jù)庫不僅源源不斷地產(chǎn)生數(shù)據(jù),而且更加注重對于數(shù)據(jù)的研發(fā)、利用,用于產(chǎn)業(yè)發(fā)展。未來,國家基因庫還將依照相關規(guī)則開放樣本、數(shù)據(jù)資源,成為一個公共服務平臺。
同時,深圳國家基因庫還與NCBI(美國國立生物技術信息中心)、EMBL-EBI(歐洲生物信息研究所)、DDBJ(日本DNA數(shù)據(jù)庫)國際知名的數(shù)據(jù)庫、樣本庫開展數(shù)據(jù)交換與資源共享共享,與末日種子庫、德國海德堡大學、美國史密斯森尼學會等形成全球聯(lián)盟體系。
技術人員在進行研究工作。
基因技術與人類生活息息相關
在人類資源方面,基因庫主要保存血液樣本、組織樣本、細胞系、細胞和尿液等,將為重大疾病的前瞻性研究提供樣本資源支撐,為疾病診斷與預測及個性化醫(yī)療等奠定基礎。
在動物資源方面,基因庫主要保存珍稀動物及具有重要經(jīng)濟價值的動物組織、細胞等。
此外,國家基因庫除了存儲人類資源、動物資源以外,還存儲植物資源、海洋資源和微生物資源。這些都可以為日后的研究工作收集大量的信息。
國家基因庫一年有5PB的數(shù)據(jù)量,相當于是1000萬個孕婦產(chǎn)前診斷的數(shù)據(jù)。如今,國家基因庫已實現(xiàn)對基因信息數(shù)據(jù)總量達65PB的訪問支持。在9月22日正式營業(yè)前,國家基因庫已實現(xiàn)對基因信息數(shù)據(jù)60PB的訪問支持,正式運營當天有5PB的數(shù)據(jù)正式對外發(fā)布,提供數(shù)據(jù)檢索和查詢功能。澎湃新聞(www.thepaper.cn)也注意到,國際基因庫的官網(wǎng)在9月22日當天也已煥然一新,首頁就是數(shù)據(jù)庫檢所查詢的頁面。
如果以一部電影500MB計算,65PB(1TB=1024GB,1PB=1024TB)相當于1.28億部電影,一個人一天看一部電影需要38萬年才能看完。
徐訊稱,基因技術看似高大上,大家以為會很少和自己有關,但大家在日常生活中已經(jīng)無形中接觸到了很多基因技術。
比如,罕見病診斷治療方面,可以從基因數(shù)據(jù)上實現(xiàn)集中管理和追本溯源。比如國家正在腸道的精準醫(yī)療就是建立在對人和跟人相關的外源性生物物種認知的基礎上,要通過基因測序來了解遺傳規(guī)律、醫(yī)學范式,這時能否擁有更多基因資源、能否掌握更多遺傳規(guī)律就非常關鍵,未來精準醫(yī)學的發(fā)展和競爭某種程度上取決于具有的基因資源以及認知基因資源的能力。再比如,中國現(xiàn)在的出生缺陷發(fā)生率大概為5.6%,怎么預防出生缺陷就是一個很大的問題,所以做產(chǎn)前檢測、孕前監(jiān)測也都是通過基因的方法來排除的。同時,最近網(wǎng)上炒得比較火的基因編輯,如果沒有“讀懂”基因,那么基因編輯技術也就沒辦法進一步發(fā)展,而“讀懂”的前提就是要有一個強大的基因庫。此外,在農(nóng)業(yè)育種方面,基因庫也大有作為。比如,袁隆平的超級水稻就是選擇合適的基因組進行的組合。
徐訊曾對媒體表示,期待1期建成后,綜合能力世界第一,包括可訪問數(shù)據(jù)量和數(shù)據(jù)存儲能力是世界第一,可訪問樣本量和樣本存儲能力也是世界第一。
對于擁有國家基因庫的重要性,梅永紅曾對南方日報稱,在農(nóng)業(yè)時代,一個國家擁有的耕地越多優(yōu)勢越大;在工業(yè)時代,擁有的石油、礦產(chǎn)等能源越多優(yōu)勢越大;而在生命時代,擁有更多的基因資源同時能對基因資源進行認知和利用,則意味著更大的優(yōu)勢。
梅永紅稱,希望搭建起基因資源挖掘的基礎性支撐平臺,形成‘生命密碼’的存、讀、懂、寫、用能力于一體,聚焦生物醫(yī)藥、生物農(nóng)業(yè)、微生物和海洋生物等領域,極大地縮短基礎科研到科技成果轉化應用周期!泵酚兰t說,國家基因庫不僅要獲得更多基因資源,對基因資源進行數(shù)字化、研發(fā)利用,還要與國內外機構開展合作,是一個浩大的系統(tǒng)工程。
據(jù)了解,國家基因庫已與國外多個國家級自然歷史博物館、挪威世界末日種子庫等機構建立合作,正式運營以后,也將與國際DNA數(shù)據(jù)庫三方組織一樣開放數(shù)據(jù)共享平臺。
公共性與商業(yè)性是否沖突?
不過,針對公共性和商業(yè)性的問題,一位業(yè)內人士告訴澎湃新聞(www.thepaper.cn),基因庫相對來說是偏公共性的事。目前國外的前三家國家級的基因庫以及生物樣本庫都是由政府成立相關機構來獨立運營的,而深圳基因庫是由具有商業(yè)性質的企業(yè)運營。該人士還稱,其實中國對于基因庫和生物樣本的保存很早就有所重視,而且國內很多家科研院所和相關機構也已有了相當多關于基因的數(shù)據(jù),而這些機構中很多并不愿意將數(shù)據(jù)提供給基因庫。同時,國家基因庫將以怎樣的模式運營目前還不并不是很清楚。
而對于公共性與商業(yè)性的界限,徐訊此前曾對媒體表示:“國家基因庫是完全獨立的,雖然由華大團隊建設和管理,但與我們的商業(yè)版塊是物理隔離的;驇鞎峁⿲ν夤卜⻊战y(tǒng)一的政策和規(guī)則,產(chǎn)業(yè)機構包括華大都必須按照規(guī)則使用這個公共平臺!
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